MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014002	AT	3	6	271398	271403	50 %	50 %	0 %	0 %	294494930
4502	NC_014002	AGG	2	6	271409	271414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494930
4503	NC_014002	TGCT	2	8	271432	271439	0 %	50 %	25 %	25 %	294494930
4504	NC_014002	GGA	2	6	271466	271471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494930
4505	NC_014002	CGG	2	6	271548	271553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494930
4506	NC_014002	AGAC	2	8	271568	271575	50 %	0 %	25 %	25 %	294494930
4507	NC_014002	TGG	2	6	271582	271587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494930
4508	NC_014002	A	6	6	271642	271647	100 %	0 %	0 %	0 %	294494930
4509	NC_014002	ATGC	2	8	271655	271662	25 %	25 %	25 %	25 %	294494930
4510	NC_014002	AGA	2	6	271676	271681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494930
4511	NC_014002	A	6	6	271684	271689	100 %	0 %	0 %	0 %	294494930
4512	NC_014002	TG	3	6	271728	271733	0 %	50 %	50 %	0 %	294494930
4513	NC_014002	CTC	2	6	271790	271795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494931
4514	NC_014002	GTT	2	6	271829	271834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494931
4515	NC_014002	TGG	2	6	271906	271911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494931
4516	NC_014002	TAA	2	6	271932	271937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494931
4517	NC_014002	TTC	2	6	271978	271983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494931
4518	NC_014002	CCG	2	6	271993	271998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494931
4519	NC_014002	GAT	2	6	272009	272014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494931
4520	NC_014002	TC	4	8	272057	272064	0 %	50 %	0 %	50 %	294494931
4521	NC_014002	T	7	7	272095	272101	0 %	100 %	0 %	0 %	294494931
4522	NC_014002	CGA	2	6	272136	272141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494931
4523	NC_014002	AAT	2	6	272216	272221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494931
4524	NC_014002	GTG	2	6	272222	272227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494931
4525	NC_014002	G	6	6	272334	272339	0 %	0 %	100 %	0 %	294494931
4526	NC_014002	CAA	2	6	272373	272378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494931
4527	NC_014002	ATT	2	6	272391	272396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494931
4528	NC_014002	AGC	2	6	272411	272416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494931
4529	NC_014002	AAT	2	6	272455	272460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494931
4530	NC_014002	GTT	2	6	272525	272530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494931
4531	NC_014002	AAT	2	6	272534	272539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494931
4532	NC_014002	GAT	2	6	272620	272625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494931
4533	NC_014002	GTT	2	6	272629	272634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494931
4534	NC_014002	TG	3	6	272711	272716	0 %	50 %	50 %	0 %	294494931
4535	NC_014002	TGT	2	6	272754	272759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494931
4536	NC_014002	TCT	2	6	272760	272765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494931
4537	NC_014002	AAGG	2	8	272813	272820	50 %	0 %	50 %	0 %	294494931
4538	NC_014002	GTG	2	6	272880	272885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494931
4539	NC_014002	GTAT	2	8	272886	272893	25 %	50 %	25 %	0 %	294494931
4540	NC_014002	CAGG	2	8	272938	272945	25 %	0 %	50 %	25 %	294494931
4541	NC_014002	T	6	6	272981	272986	0 %	100 %	0 %	0 %	294494931
4542	NC_014002	TAC	2	6	272989	272994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494931
4543	NC_014002	GT	3	6	272997	273002	0 %	50 %	50 %	0 %	294494931
4544	NC_014002	TCT	2	6	273025	273030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494931
4545	NC_014002	TGAG	2	8	273208	273215	25 %	25 %	50 %	0 %	294494932
4546	NC_014002	GAA	2	6	273225	273230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494932
4547	NC_014002	ATG	2	6	273268	273273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494932
4548	NC_014002	GCAGTT	2	12	273294	273305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294494932
4549	NC_014002	TGC	2	6	273371	273376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494932
4550	NC_014002	GC	3	6	273375	273380	0 %	0 %	50 %	50 %	294494932
4551	NC_014002	GGT	2	6	273396	273401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494932
4552	NC_014002	GAA	2	6	273465	273470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494932
4553	NC_014002	GTG	2	6	273487	273492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494932
4554	NC_014002	TCAA	2	8	273503	273510	50 %	25 %	0 %	25 %	294494932
4555	NC_014002	CCA	2	6	273557	273562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494932
4556	NC_014002	ACC	2	6	273757	273762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494932
4557	NC_014002	TTC	2	6	273766	273771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494932
4558	NC_014002	GCA	2	6	273780	273785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494932
4559	NC_014002	CAA	2	6	273797	273802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494932
4560	NC_014002	GCTG	2	8	273890	273897	0 %	25 %	50 %	25 %	294494932
4561	NC_014002	GCA	2	6	273902	273907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494932
4562	NC_014002	CAA	2	6	273953	273958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494932
4563	NC_014002	GGC	2	6	274032	274037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494932
4564	NC_014002	TA	3	6	274071	274076	50 %	50 %	0 %	0 %	294494932
4565	NC_014002	ATG	2	6	274218	274223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494933
4566	NC_014002	T	6	6	274286	274291	0 %	100 %	0 %	0 %	294494933
4567	NC_014002	GCA	2	6	274293	274298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494933
4568	NC_014002	TGC	2	6	274358	274363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494933
4569	NC_014002	GGA	2	6	274466	274471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494933
4570	NC_014002	GAT	2	6	274575	274580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494933
4571	NC_014002	TA	3	6	274611	274616	50 %	50 %	0 %	0 %	294494933
4572	NC_014002	CAA	2	6	274664	274669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494933
4573	NC_014002	A	6	6	274684	274689	100 %	0 %	0 %	0 %	294494933
4574	NC_014002	GA	3	6	274886	274891	50 %	0 %	50 %	0 %	294494933
4575	NC_014002	CTT	2	6	274892	274897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494933
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4578	NC_014002	TTGA	2	8	274944	274951	25 %	50 %	25 %	0 %	294494934
4579	NC_014002	TGT	2	6	275105	275110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494934
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4581	NC_014002	TTAC	2	8	275315	275322	25 %	50 %	0 %	25 %	294494935
4582	NC_014002	TCT	2	6	275339	275344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494935
4583	NC_014002	TGC	2	6	275359	275364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494935
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4585	NC_014002	T	6	6	275478	275483	0 %	100 %	0 %	0 %	294494935
4586	NC_014002	AGGTC	2	10	275561	275570	20 %	20 %	40 %	20 %	294494935
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4588	NC_014002	TTCA	2	8	275596	275603	25 %	50 %	0 %	25 %	294494935
4589	NC_014002	TCCA	2	8	275614	275621	25 %	25 %	0 %	50 %	294494935
4590	NC_014002	ACC	2	6	275642	275647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494935
4591	NC_014002	CTAC	2	8	275663	275670	25 %	25 %	0 %	50 %	294494935
4592	NC_014002	CCTTG	2	10	275681	275690	0 %	40 %	20 %	40 %	294494935
4593	NC_014002	TCA	2	6	275711	275716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494935
4594	NC_014002	T	6	6	275749	275754	0 %	100 %	0 %	0 %	294494935
4595	NC_014002	TGA	2	6	275823	275828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494935
4596	NC_014002	ATTGGC	2	12	275830	275841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294494935
4597	NC_014002	ATC	2	6	276010	276015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494935
4598	NC_014002	TCG	2	6	276143	276148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494935
4599	NC_014002	TTC	2	6	276262	276267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494935
4600	NC_014002	GCG	2	6	276376	276381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494935
4601	NC_014002	TC	3	6	276487	276492	0 %	50 %	0 %	50 %	294494935
4602	NC_014002	CAA	2	6	276543	276548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494935
4603	NC_014002	ATT	2	6	276551	276556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494935
4604	NC_014002	TCA	2	6	276578	276583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494935
4605	NC_014002	GTA	2	6	276616	276621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494935
4606	NC_014002	ATT	2	6	276629	276634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494935
4607	NC_014002	TGA	2	6	276651	276656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494935
4608	NC_014002	CGG	2	6	276712	276717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494935
4609	NC_014002	CCG	2	6	276830	276835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494935
4610	NC_014002	CTG	2	6	276889	276894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494935
4611	NC_014002	TGA	2	6	276918	276923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494935
4612	NC_014002	AAT	2	6	277015	277020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494935
4613	NC_014002	ATGTT	2	10	277049	277058	20 %	60 %	20 %	0 %	294494935
4614	NC_014002	TGT	2	6	277074	277079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494935
4615	NC_014002	CCTG	2	8	277233	277240	0 %	25 %	25 %	50 %	294494935
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4618	NC_014002	TGT	2	6	277634	277639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494936
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4621	NC_014002	TATT	2	8	277990	277997	25 %	75 %	0 %	0 %	294494937
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4623	NC_014002	CTA	2	6	278102	278107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494937
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4989	NC_014002	TCC	2	6	296759	296764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494960
4990	NC_014002	TCA	2	6	296829	296834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494960
4991	NC_014002	TTG	2	6	296964	296969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494960
4992	NC_014002	AAT	2	6	297004	297009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494960
4993	NC_014002	CGT	2	6	297061	297066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494960
4994	NC_014002	ATC	2	6	297083	297088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494960
4995	NC_014002	TTC	2	6	297094	297099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494960
4996	NC_014002	GT	3	6	297197	297202	0 %	50 %	50 %	0 %	294494960
4997	NC_014002	ATTT	2	8	297245	297252	25 %	75 %	0 %	0 %	294494960
4998	NC_014002	AGT	2	6	297283	297288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494960
4999	NC_014002	T	8	8	297296	297303	0 %	100 %	0 %	0 %	294494960
5000	NC_014002	CAT	2	6	297421	297426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494960

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